在两国的间谍活动方面,90年代以来被披露的主要事件有:1994年1月,一名俄罗斯公司经理瓦迪姆·辛特索夫(Vadim Sintsov)因为替英国充当间谍被捕入狱,判刑10年。1994年4月,英国驱逐一名俄外交官,作为对俄方驱逐一名英国外交官的报复,该外交官被指控为英国在俄罗斯的间谍机构头目。1996年5月,俄罗斯指责9名英国外交人员组成一个间谍集团,将他们驱逐出境,英国则驱逐4名俄外交官作为回应。2000年7月,一名俄罗斯外交官普拉通·奥布霍夫(Platon Obukov)被本国司法机关指控为英国进行间谍活动,判刑11年。2004年4月,俄武器专家伊戈尔·苏特亚京(Igor Sutyagin)被判犯有叛国罪,获刑15年。两国间频频发生的间谍事件使双方更加难以互信,两国关系也经常处在碰撞之中。
第三,西方对俄罗斯抱有成见,使英、俄关系很难得到真正的改善。比如,英国认为俄罗斯仍然是苏联的延续,将普京描绘为“新沙皇”。英国对俄罗斯加强国防力量的努力疑虑重重,虽然它很少公开说俄罗斯构成了安全威胁,但抱有的戒心却很强烈。英国批评俄罗斯没有法治、不讲秩序,指责俄拒绝引渡卢戈沃伊是袒护犯罪,俄罗斯则坚称其宪法不允许将本国公民引渡到其他国家,俄不能服从英国法院的指令。俄罗斯还对英国司法体系的独立性提出质疑,不相信英国法院会不顾英国政府的意愿而独立审案。双方对对方的基本判断如此对立,就很难真正建立起良好的关系。